На 5 курсе женился на однокурснице Элеоноре Бисяриной, на 6 курсе родился сын Александр. По окончанию института, по распределению, вместе с женой были направлены в областную психиатрическую больницу г. Оренбурга. В 1966 году молодые врачи, супруги Можаевы, поступают в Саратовский государственный университет на механико – математический факультет, чтобы в последствии заниматься нейрокибернетикой. Областную психиатрическую больницу Оренбурга, в которой работают супруги Можаевы прверяет комиссия Минздрава РСФСР и председателя комиссии, заместителя организационно – методического отдела Минздрава, заинтересовали молодые врачи, которые работают над повышением своего профессионального уровня - учатся в университете. Борис и Элеонора были приглашены в систему здравоохранения Московской области. Вот так Борис Александрович попал в Хотьково, в Московскую Областную Психиатрическую Больницу № 5 (МОПБ №5) где проработал два года. Необходимо было решать вопрос с жильем. С этой целью Б.А. Можаев переходит на работу в институт вирусологии Министерства обороны. В 1971 год родился второй сын Дмитрий и семья Можаевых получила квартиру. В 1977 году Борис Александрович защитил кандидатскую диссертацию по закрытой тематике и в конце того же года заразился особо опасным возбудителем, с которым работал в институте. Неделю был без сознания. С точки зрения врачей – в безнадежном состоянии. Жена, к тому времени была верующим человеком, убедившись в бессилии врачей, пошла за помощью к Преподобному Сергию.
Из книги «Новые чудеса Преподобного Сергия». До принятия священного сана Борис был врачем. Однажды он тяжело заболел, лежал в больничной палате без сознания. Жена, тоже врач по специальности, услышала от заведующего отделением приговор: «Смерть – вопрос короткого времени». Поскольку она была верующей, то единственным утешением и помощью для нее была молитва, и она сразу же решила ехать в Лавру к преподобному Сергию, чтобы излить перед ним свое горе. Тяготило ее не столько то, что она , молодая, но уже с сильно подорванным здоровьем женщина, остается с двумя детьми, никому не нужная, обреченная на одиночество и лишения, сколько тоска от того, что самый близкий человек, с которым она делила радости и невзгоды уже пятнадцать лет, пойдет из-за своего неверия в муку вечную, без надежды на прощение и спасение.
В Лавре она горячо молилась Преподобному о спасении супруга. Встав после молитвы у раки святого, она почувствовала – будто камень упал у нее с души. И в этот же день муж вдруг пришел в сознание, а с наступлением ночи состояние его заметно улучшилось. После этого он стал поправляться и выздоровел.
Узнав от жены, что получил исцеление благодаря чудесной помощи Преподобного Сергия, он уверовал, начал усердно посещать храм, исповедоваться, причащаться. Новые убеждения были несовместимы с работой в закрытом научном институте. Пришлось вернуться в МОПБ №5, но уже в качестве нарколога.
В 1988 году в Хотьково начинает действовать Покровский храм, в прошлом часть Хотьковского женского монастыря. В 1989 г. Борис Александрович становиться алтарником этого храма. В1990 г. рукоположен в дьякона к Покровскому храму г. Хотьково, с работой врача было покончено.